Hemligheten tynger ner familjelivet i Albuquerque, särskilt då Walters svåger arbetar som narkotikaagent på DEA och ovetande jagar den mystiske kriminella ledaren som går under namnet Heisenberg. Samarbetet med Jesse präglas av ständiga konflikter, desperation och livsfarliga misstag som tvingar duon att konfrontera skoningslösa karteller och sadistiska distributörer.

Berättelsen drivs av en gradvis moralisk kollaps där den plågade läraren förvandlas till en hänsynslös maktspelare. Fokus ligger på den psykologiska metamorfosen och konsekvenserna av att korsa gränsen mellan laglydig medborgare och kallblodig brottsling.